Первая современная работа с принципиальной схемой оптимизации агроэкосистемы с учетом трофической структуры была разработана уфимскими агроэкологами (Миркин и др.,1992). Предложенная схема включает три этапа операций:

1.Составление базы исходных данных;

2.Синтетическая оценка сложившейся структуры агроэкосистемы;

3.Собственно оптимизационные процедуры.

Последний этап реализуется как одна или несколько возможных альтернативных вариантов решений. Данная работа по новизне содержания является революционной в плане развития технологий экологической оптимизации сельскохозяйственных экосистем.