На территории Башкортостана выявлено 120 видов одноклеточных, около 700 видов червей, 121 - моллюсков, около 5000 - членистоногих. 47 - рыб, 10 - земноводных, 10 - пресмыкающихся, 296 птиц, 76 - млекопитающих. Животные обитают во всех средах (воде. почве, воздушном бассейне). По количеству видов и особей беспозвоночные животные доминируют во всех средах жизни, играют важную роль в природных биоценозах. Многие виды животных имеют обширный ареал, однако ареалы некоторых европейских видов ограничены Уральскими горами. Так, по территории РБ проходит восточная граница распространения ряда видов рыб: ручьевой форели, европейского хариуса, судака, берша, сазана, голавля, подуста, жереха, чехони, быстрянки, леща, белоглазки, густеры, синца, обыкновенного сома н др. Сев. граница ареала южного малой колюшки достигает оз.Яктыкуль. Уральскими горами ограничено распространение прудовой и травяной лягушек, краснобрюхой жерлянки и гребенчатого тритона. Лишь в южной части Башкортостана изредка встречаются болотная черепаха и степная гадюка. В Башкирском Зауралье зарегистрированы огарь, черный турпан, белая куропатка, шилоклювка, кречетка, белокрылый жаворонок, каменка-плясунья, малая мухоловка, а в Башкирском Предуралье пеночка- трещотка, крапивник; др. птицы имеют широкий ареал. Из млекопитающих только в южных районах встречаются пищуха малая, хомяки серый и Эверсмана, а рыжеватый или большой суслик населяет районы, расположенные на левобережье р.Белой. В республике обитает несколько видов позвоночных, завезенных с целью обогащения фауны (из рыб - сиг-лудога, рипус, пелядь, белый амур н толстолобик; из млекопитающих - выхухоль, ондатра; реакклиматизированы марал, бобр, сурок степной которые были уничтожены ранее). Имеются и случайные поселенцы (игла-рыба в оз. Асылыкуль и ротан-головешка в ряде водоемов республики). Большинство видов животных распространено по всей территории Башкортостана. Отдельные виды приурочены к определенным эколого- географическим условиям. Открытые пространства населяют сурок, тушканчик, заяц-русак, степной хорёк, серая куропатка, полевой жаворонок: леса - медведь, рысь, куница, бурундук, белка, рябчик: водоемы - бобр. выдра, ондатра, утки, чайки, поганки, болотная черепаха и др. Некоторые виды рыб обитают только в реках (хариус, подуст, стерлядь и др.) и стоячих водоемах (карась, линь и др.). По характеру пищевых связей животные подразделяются на несколько групп. Большое количество их относится к растительноядным (траво-, листо-, зерно-, плодоядные, короеды и др.), млекопитающих - копытные и грызуны, из итиц - гуси и куриные, из рыб краснопёрка, белый амур и толстолобик, из беспозвоночных в основном насекомые. Наиболее разнообразную группу животных представляют хищники, которые распространены широко, от инфузорий до зверей. Известна группа животных (дождевые черви, наземные и водные улитки, почвенные нематоды и клещи, многоножки, различные насекомые - капрофаги и трупоеды), которая является деструктором детрита, т.е. разлагающим растит. остатки, останки животных и др. Среди животных есть паразиты, питающиеся тканями др. живых организмов и являющиеся источниками возбудителей болезней. Они встречаются во всех гр. беспозвоночных. Основу промысла и любительского улова в республике составляют следующие рыбы: окунь, щука, плотва, лещ, густера, зол.и серебряные караси, голавль, язь, реже чехонь, уклейка, елец, судак, жерех. В прудовых и садковых хозяйствах выращивают в основном карпов (чешуйчатый, зеркальный, рамочный), нередко совместно с толстолобиком и белым амуром. Уфимский сиговый (рыборазвод с 1958) завод специализируется на инкубировании икры сига н пеляди, личинки которых затем выпускают в озера для подращивания до промысловых размеров. Объектами спортивной охоты являются утиные: чирок-свистунок, чирок-трескунок, кряква, красноголовый нырок, хохлатая чернеть, реже серая утка, свиязь, широконоска и др. В определенное время открывается охота на боровую дичь (рябчик, тетерев, глухарь), а из куликов - на вальдшнепа. К числу охотничьих зверей, добываемых в республике, относятся многие представители семейства куньих (куница, американская норка, колонок, горностай, ласка, светлый хорек, барсук), собачьих (волк, лисипа, енотовидная собака), зайцев - беляк и русак. Добыча лося, косули, кабана, медведя, бобра осуществляется строго но нормам. Под влиянием хозяйственной деятельности человека, в результате разрушения местообитания, загрязнения водоемов и полей, прямого истребления некоторых видов животных сократилась их численность, они стали редкими (или совершенно исчезли) на территории республики. В пределах РБ перестали гнездиться пеликан, пеганка, стрепет, дрофа, степной орёл, истреблен выхухоль. Редкие виды животных (многие хищные птицы, пресмыкающиеся, лососевые рыбы, некоторые насекомые, млекопитающие) занесены в Красную книгу Башкирской АССР.